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一、培訓班上課內容 
      上課內容涵蓋“基因組學―蛋白質組學―系統(tǒng)生物學”的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。 
核心課程包括： 
1. 基因組的比較研究、DNA測序技術原理與進展（講課人：于 軍 教授） 
2. 轉錄組的測定與分析、大規(guī)模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與醫(yī)學（講課人：胡松年教授） 
3. 系統(tǒng)生物學建模分析及高通量分析技術應用（講課人：楊軍、陳銘教授等） 
4. 蛋白質組學概論及應用 （講課人：鐘伯雄教授）

二、培訓班上機內容 
      上機實習課采用 “跟我學”方式，學習實踐各類基礎生物信息學軟件，每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數(shù)據分析的基本方法。

主要內容如下： 
實習一： 基因組數(shù)據注釋和功能分析
      通過序列比對工具BLAST的學習，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法，認識基因復制在進化上的功能；學習基因序列分析常用的數(shù)據庫和軟件。 
實習二： 轉錄組數(shù)據分析
      介紹轉錄組數(shù)據分析的基本流程及其原理；通過對tophat、cufflinks、R等轉錄組數(shù)據分析工具的介紹及演示，了解基于二代測序數(shù)據的轉錄組分析流程及常用分析方法； 利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉錄組數(shù)據的生物學意義。 
實習三：系統(tǒng)生物學軟件實習-----網絡結構顯示與分析 
      利用Cytoscape系統(tǒng)生物學分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網絡系統(tǒng)，并與基因表達等數(shù)據整合。 
實習四：蛋白質結構與功能分析 
      從數(shù)據庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始，接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析，預測目標蛋白的生物功能。 
實習五： 蛋白質組質譜分析 
      使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質質譜數(shù)據，將質譜結果匹配到蛋白質組數(shù)據庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進行統(tǒng)計學分析和優(yōu)化檢索結果練習。

三、培訓對象 

無生物信息學背景，希望了解生物信息學的學員； 
計劃開展各類組學研究的科研人員； 
已有組學數(shù)據需了解分析方法的研究人員； 
有志從事生物信息學相關工作的學生或者技術人員。